La información del transcriptoma y el metatranscriptoma microbianos es importante para predecir la resistencia a antibióticos específicos, comprender las interacciones inmunitarias entre el huésped y el patógeno, cuantificar los cambios en la expresión génica y hacer un seguimiento de la progresión de la enfermedad. El RNA-Seq (secuenciación de ARN) de próxima generación de bacterias, virus y otros microbios se ha convertido en un método estándar para analizar la información del transcriptoma y el metatranscriptoma
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