Las herramientas de bioinformática son programas de software que están diseñados para extraer información significativa de la masa de biología molecular/bases de datos biológicas & para realizar análisis de secuencias o estructurales. Hay software de minería de datos que recupera datos de bases de datos de secuencias genómicas y también herramientas de visualización para analizar y recuperar información de bases de datos proteómicas. Estos se pueden clasificar como herramientas de homología y similitud, herramientas de análisis funcional de proteínas, herramientas de análisis de secuencias y herramientas misceláneas.
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