La biblioteca de cDNA es una combinación de fragmentos de cDNA clonados insertados en una colección de células huésped, que juntas constituyen una parte del transcriptoma del organismo. El ADNc se produce a partir del ARNm completamente transcrito que se encuentra en el núcleo. La información en las bibliotecas de cDNA es una herramienta poderosa y útil ya que los productos genéticos se identifican fácilmente, las bibliotecas carecen de información sobre potenciadores, intrones y otros elementos reguladores que se encuentran en una biblioteca de ADN genómico.
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