El Proyecto del Proteoma Humano (HPP) es un proyecto internacional iniciado por la Organización del Proteoma Humano (HUPO). Se puede determinar la aparición de nuevas técnicas como la espectrometría de masas y la ionización por electropulverización del proteoma humano para mejorar la comprensión de la biología a nivel celular. El HPP basado en cromosomas tiene como objetivo desarrollar nuestra comprensión del proteoma humano con un enfoque en ampliar la comprensión de todos y cada uno de los genes en cada cromosoma. El HPP basado en biología/enfermedad tiene como objetivo ampliar nuestra comprensión del proteoma humano centrándose en aspectos importantes de la investigación biológica y en la investigación continua centrada en la enfermedad. El Proyecto del Genoma Humano llevó al descubrimiento de que los genes que codifican proteínas son mucho menos que las proteínas que se encuentran en los humanos. Esta diversidad en la proteína se debe al empalme alternativo y las modificaciones postraduccionales de las proteínas. Por lo tanto, las proteínas son muy buenos biomarcadores para diferentes enfermedades.
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