Las estrategias de ingeniería de proteínas destinadas a construir enzimas con actividades, especificidades y estabilidades mejoradas se benefician enormemente de los métodos in silico. Los métodos computacionales se pueden agrupar principalmente en tres categorías principales. Son la bioinformática, el modelado molecular y el diseño de novo. El diseño de enzimas computacionales es un área de investigación muy prometedora. Las herramientas de diseño computacional actuales adolecen de una seria limitación.
Las estrategias de ingeniería de proteínas destinadas a construir enzimas con actividades, especificidades y estabilidades novedosas o mejoradas se benefician enormemente de los métodos in silico. Los métodos computacionales se pueden agrupar principalmente en tres categorías principales: bioinformática; modelado molecular; y diseño de novo. En particular, el diseño de proteínas de novo está experimentando un rápido desarrollo, lo que da como resultado predicciones más sólidas y confiables. Una tendencia reciente en el campo es combinar varios enfoques computacionales de manera interactiva y complementarlos con análisis estructural y evolución dirigida. Una investigación detallada de los catalizadores diseñados proporciona información valiosa sobre la base estructural del reconocimiento molecular, la catálisis bioquímica y la evolución de proteínas naturales.
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