La caracterización de proteínas de organismos, sus fluidos corporales o extractos es el principal objetivo de la elaboración de perfiles de Proteoma. Por lo tanto, el perfilado de un proteoma sirve como base para el estudio de los cambios cuantitativos y la modificación de las proteínas objetivo. Los cambios dinámicos que ocurren en los sistemas se pueden estudiar mediante perfiles junto con la combinación de transcriptómica.
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