Una técnica química analítica que se utiliza para determinar la cantidad de proteínas en la muestra dada es la proteómica cuantitativa. El análisis global de la expresión de proteínas se utiliza cada vez más como un método para estudiar cambios en los perfiles de proteínas en estado estacionario e inducidos por perturbaciones. Las diferencias en la expresión de proteínas entre diferentes estados biológicos de la célula, es decir, control frente a tratamiento, sano frente a enfermedad, genotipo específico frente a tipo salvaje. Se descubrieron biomarcadores candidatos específicos del modelo de ántrax murino para comparar la respuesta de las cepas toxigénicas y no toxigénicas. El análisis de proteómica de los fluidos corporales es un obstáculo debido a la presencia de abundantes proteínas que interfieren con las tecnologías de perfilado de proteomas como SELDI con la resolución y la sensibilidad. Así, los fluidos corporales de los ratones utilizados en el experimento se fraccionan en grupos de proteínas para separar el análisis de los grupos.
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