La bioquímica del suelo es la rama de la ciencia del suelo que se ocupa de la formación y descomposición de la materia orgánica del suelo, las reacciones bioquímicas de carbono, nitrógeno, azufre, fósforo, metales y xenobióticos en los suelos, y la bioquímica de la rizosfera de las raíces de las plantas. Las reacciones bioquímicas del suelo se refieren principalmente a la fracción orgánica, aunque se compone del 55% del volumen total del suelo.