Clarisa Erica
Los datos de la secuenciación de ARN de células individuales pueden revelar la variedad molecular de los diferentes tipos de células. Las publicaciones recientes de atlas de tipos de células para la médula espinal del ratón aún no se han combinado. Aquí, utilizando datos del transcriptoma de células individuales, creamos un atlas de tipos de células espinales, combinando los diversos conjuntos de datos en un único marco de referencia. Presentamos un marco jerárquico de interacciones de tipos de células postnatales, donde la ubicación sirve como el nivel más alto de organización, seguido del estado de los neurotransmisores, la familia y docenas de poblaciones refinadas. Mapeamos las distribuciones geográficas de cada tipo de célula neuronal en la médula espinal adulta y validamos un código marcador combinatorio para cada una. También demostramos vínculos de linaje intrincados entre varios tipos de células postnatales. Para ayudar en la estandarización de la identificación de tipos de células, también creamos el clasificador de tipos de células de código abierto SeqSeek. Este trabajo proporciona una comprensión integrada de los diversos tipos de células espinales, su disposición molecular y sus perfiles de expresión genética.